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南京商業學校建有財經系、信息工程系、國際貿易系、旅游管理系、汽車服務系和國際教育學院5系1院。師資力量雄厚，擁有“國家級烹飪大師”、江蘇省“六大人才高峰”高層次人才、江蘇省“333”高層次人才、江蘇省職業教育領軍人才、江蘇省特級教師、教授、市區學科帶頭人、市區優秀青年教師等名師團隊近百人。學校的會計、烹飪、物流三個專業教師團隊均為南京市“優秀教學團隊”。擁有物流服務與管理、中餐烹飪、計算機網絡技術三大“江蘇省現代化專業群”，會計、烹飪、物流、電子商務、酒店、汽修、計算機網絡技術七大“江蘇省品牌專業”。烹飪、會計等一批“國家級實訓基地”、“江蘇省高水平現代化實訓基地”。
南京商業學校注重學生的全面發展，校園生活豐富多彩，100多個精品社團為學生提供了廣闊的舞臺，多個項目在國際、全國重要賽事中獲得優異成績。
南京商業學校在各級技能大賽中先后獲得12塊國賽金牌，89塊省賽金牌，100多名金牌學生被保送到南京航空航天大學、南京財經大學、南京藝術學院、揚州大學、金陵科技學院、南京曉莊學院等高校本科深造。學校連續5年畢業生就業質量跟蹤調查名列南京市區第一名。
南京商業學校廣泛開展國際交流與合作，與美國、加拿大、英國、澳大利亞共同開設中美國際商務班、中加藝術高中班、中英HND班等項目。學校注重校企合作，與中國動漫集團掛牌成立“中國動漫集團南京文化創意學院”，與聯想集團掛牌成立“聯想學院”，與京東企業共建“京東校園雙創實訓孵化基地”、“京東校園館”等。
